Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME1Q96AY2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms