Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-212ENST00000508797 1074 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BUD23-212ENST00000453316 452 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 REEP5-206ENST00000511865 1187 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-206ENST00000468727 667 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-248ENST00000636669 2410 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TTC27-206ENST00000454690 500 ntTSL 313.14□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CAD-204ENST00000456311 837 ntTSL 513.11□□□□□ -0.319e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CDHR1-206ENST00000623527 6781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CEP63-216ENST00000620544 1601 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.319e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC57-208ENST00000475635 571 ntTSL 413.09□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.329e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SDC3-204ENST00000487984 355 ntTSL 313.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C2-208ENST00000452202 539 ntTSL 413.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HAPLN2-203ENST00000482204 679 ntTSL 213.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PXK-208ENST00000477308 1610 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF20-208ENST00000461405 550 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EMC8-203ENST00000595980 556 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GPAA1-215ENST00000530796 936 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYH9-205ENST00000463027 562 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CTSC-202ENST00000393301 598 ntTSL 213□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PFKP-211ENST00000495715 143 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-208ENST00000566189 939 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CMTM1-203ENST00000333001 883 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.339e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL20RB-203ENST00000475972 1787 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.349e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL9-218ENST00000515773 8150 ntTSL 212.94□□□□□ -0.344e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-215ENST00000472911 543 ntTSL 212.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-209ENST00000567512 615 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SVIP-205ENST00000533774 829 ntTSL 312.94□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BUD23-211ENST00000442099 691 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-204ENST00000459995 594 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPRYD3-201ENST00000301463 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-222ENST00000567890 612 ntTSL 512.9□□□□□ -0.349e-12■■■■■ 149.1
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UTP3Q9NQZ2 BZW2-204ENST00000415365 1405 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CNOT10-218ENST00000494439 551 ntTSL 512.89□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GMPR-202ENST00000540478 793 ntTSL 212.89□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-220ENST00000564201 752 ntTSL 512.89□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CNOT10-219ENST00000556853 551 ntTSL 412.89□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-214ENST00000550339 500 ntTSL 212.89□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL20RB-204ENST00000484501 427 ntTSL 412.88□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.354e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C3orf20-203ENST00000435614 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC136632.1-201ENST00000477964 591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-227ENST00000552577 2083 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-228ENST00000552879 568 ntTSL 412.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF11-203ENST00000461678 536 ntTSL 312.7□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 312.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-206ENST00000545748 3511 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.389e-12■■■■■ 149.1
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UTP3Q9NQZ2 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.389e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPEP2-208ENST00000575203 2248 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN1-213ENST00000482192 793 ntTSL 312.63□□□□□ -0.394e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CTSC-209ENST00000534131 583 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CENPBD1P1-206ENST00000493504 3282 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 UBR1-206ENST00000566493 598 ntTSL 312.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DIP2A-210ENST00000480553 1906 ntTSL 212.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS3-203ENST00000343817 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EDC3-204ENST00000562174 761 ntTSL 212.59□□□□□ -0.399e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS3-227ENST00000496113 641 ntTSL 412.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZBED9-204ENST00000530247 755 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PPM1F-205ENST00000445205 650 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAPGEF5-209ENST00000475788 728 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAD54L2-203ENST00000461680 5129 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OGDHL-202ENST00000419399 3588 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAD54L2-205ENST00000487093 4782 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC013652.2-201ENST00000558245 345 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAB31-209ENST00000580795 342 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-210ENST00000515005 368 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-211ENST00000529834 2248 ntTSL 212.46□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1F-222ENST00000613525 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GPR137-210ENST00000538244 350 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1545.8 ms