Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A3Q9BRY0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms