Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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