Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms