RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.38■■■■■ 5.5
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HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.19■■■■■ 4.5
HOXD12-201ENST00000404162 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.75■■■■■ 4.43
HOXD12-201ENST00000404162 NACADO15069 1562 aa42.29■■■■■ 4.36
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HOXD12-201ENST00000404162 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXD12-201ENST00000404162 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.85■■■■■ 4.29
HOXD12-201ENST00000404162 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.6■■■■■ 4.25
HOXD12-201ENST00000404162 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.46■■■■■ 4.23
HOXD12-201ENST00000404162 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.87■■■■■ 4.13
HOXD12-201ENST00000404162 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.85■■■■■ 4.13
HOXD12-201ENST00000404162 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.83■■■■■ 4.13
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HOXD12-201ENST00000404162 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXD12-201ENST00000404162 SCRIBQ14160 1630 aa40.61■■■■■ 4.09
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.08■■■■■ 4.01
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HOXD12-201ENST00000404162 NCAPD3P42695 1498 aa39.08■■■■□ 3.85
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HOXD12-201ENST00000404162 SMARCA2P51531 1590 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCA4P51532 1647 aa38.66■■■■□ 3.78
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HOXD12-201ENST00000404162 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.26■■■■□ 3.72
HOXD12-201ENST00000404162 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.19■■■■□ 3.7
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HOXD12-201ENST00000404162 TRIM41Q8WV44 630 aa38.07■■■■□ 3.68
HOXD12-201ENST00000404162 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXD12-201ENST00000404162 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.81■■■■□ 3.64
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HOXD12-201ENST00000404162 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.52■■■■□ 3.6
HOXD12-201ENST00000404162 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXD12-201ENST00000404162 OSCARQ8IYS5 282 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXD12-201ENST00000404162 CFTRP13569 1480 aa37.28■■■■□ 3.56
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HOXD12-201ENST00000404162 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
HOXD12-201ENST00000404162 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXD12-201ENST00000404162 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXD12-201ENST00000404162 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM2Q13029 1718 aa36.82■■■■□ 3.49
HOXD12-201ENST00000404162 IFT140Q96RY7 1462 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF11O15085 1522 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXD12-201ENST00000404162 TOPBP1Q92547 1522 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.64■■■■□ 3.46
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HOXD12-201ENST00000404162 ABCC8Q09428 1581 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXD12-201ENST00000404162 CHD1O14646 1710 aa36.46■■■■□ 3.43
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HOXD12-201ENST00000404162 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXD12-201ENST00000404162 ARAP1Q96P48 1450 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXD12-201ENST00000404162 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
HOXD12-201ENST00000404162 FBLN2P98095 1184 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD12-201ENST00000404162 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXD12-201ENST00000404162 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
HOXD12-201ENST00000404162 SOGA1O94964 1423 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXD12-201ENST00000404162 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD12-201ENST00000404162 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
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HOXD12-201ENST00000404162 SYNJ1O43426 1573 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXD12-201ENST00000404162 WDR97A6NE52 1622 aa35.89■■■■□ 3.34
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HOXD12-201ENST00000404162 GRIN2BQ13224 1484 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXD12-201ENST00000404162 CUX1P39880 1505 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXD12-201ENST00000404162 SYNJ2O15056 1496 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXD12-201ENST00000404162 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.68■■■■□ 3.3
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HOXD12-201ENST00000404162 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.47■■■■□ 3.27
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HOXD12-201ENST00000404162 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXD12-201ENST00000404162 GRIN2AQ12879 1464 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXD12-201ENST00000404162 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXD12-201ENST00000404162 NUP160Q12769 1436 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS12P58397 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXD12-201ENST00000404162 SHROOM2Q13796 1616 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXD12-201ENST00000404162 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
HOXD12-201ENST00000404162 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXD12-201ENST00000404162 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXD12-201ENST00000404162 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXD12-201ENST00000404162 TOP2BQ02880 1626 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXD12-201ENST00000404162 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
HOXD12-201ENST00000404162 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXD12-201ENST00000404162 JPH4Q96JJ6 628 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
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