Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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ACTBP60709 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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