Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM16LQ309B1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms