Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL20Q9Y2M5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL20Q9Y2M5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL20Q9Y2M5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms