Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A6Q9Y289 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A6Q9Y289 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A6Q9Y289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms