Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MED23Q9ULK4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MED23Q9ULK4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MED23Q9ULK4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MED23Q9ULK4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms