Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP1R9AQ9ULJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R9AQ9ULJ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R9AQ9ULJ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R9AQ9ULJ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms