Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PPP1R9AQ9ULJ8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPP1R9AQ9ULJ8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PPP1R9AQ9ULJ8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PPP1R9AQ9ULJ8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PPP1R9AQ9ULJ8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PPP1R9AQ9ULJ8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PPP1R9AQ9ULJ8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PPP1R9AQ9ULJ8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPP1R9AQ9ULJ8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PPP1R9AQ9ULJ8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PPP1R9AQ9ULJ8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PPP1R9AQ9ULJ8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPP1R9AQ9ULJ8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PPP1R9AQ9ULJ8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PPP1R9AQ9ULJ8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPP1R9AQ9ULJ8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPP1R9AQ9ULJ8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPP1R9AQ9ULJ8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPP1R9AQ9ULJ8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPP1R9AQ9ULJ8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPP1R9AQ9ULJ8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPP1R9AQ9ULJ8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPP1R9AQ9ULJ8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPP1R9AQ9ULJ8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPP1R9AQ9ULJ8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPP1R9AQ9ULJ8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPP1R9AQ9ULJ8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPP1R9AQ9ULJ8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPP1R9AQ9ULJ8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPP1R9AQ9ULJ8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPP1R9AQ9ULJ8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPP1R9AQ9ULJ8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPP1R9AQ9ULJ8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PPP1R9AQ9ULJ8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PPP1R9AQ9ULJ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PPP1R9AQ9ULJ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPP1R9AQ9ULJ8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPP1R9AQ9ULJ8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP1R9AQ9ULJ8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP1R9AQ9ULJ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PPP1R9AQ9ULJ8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPP1R9AQ9ULJ8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PPP1R9AQ9ULJ8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP1R9AQ9ULJ8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PPP1R9AQ9ULJ8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PPP1R9AQ9ULJ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PPP1R9AQ9ULJ8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PPP1R9AQ9ULJ8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PPP1R9AQ9ULJ8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PPP1R9AQ9ULJ8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PPP1R9AQ9ULJ8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R9AQ9ULJ8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R9AQ9ULJ8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R9AQ9ULJ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PPP1R9AQ9ULJ8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R9AQ9ULJ8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PPP1R9AQ9ULJ8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPP1R9AQ9ULJ8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPP1R9AQ9ULJ8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPP1R9AQ9ULJ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPP1R9AQ9ULJ8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPP1R9AQ9ULJ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPP1R9AQ9ULJ8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R9AQ9ULJ8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R9AQ9ULJ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPP1R9AQ9ULJ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPP1R9AQ9ULJ8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R9AQ9ULJ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPP1R9AQ9ULJ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP1R9AQ9ULJ8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPP1R9AQ9ULJ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPP1R9AQ9ULJ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP1R9AQ9ULJ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP1R9AQ9ULJ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP1R9AQ9ULJ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPP1R9AQ9ULJ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPP1R9AQ9ULJ8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP1R9AQ9ULJ8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PPP1R9AQ9ULJ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP1R9AQ9ULJ8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R9AQ9ULJ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R9AQ9ULJ8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPP1R9AQ9ULJ8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP1R9AQ9ULJ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms