Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR3Q9UJK0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR3Q9UJK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR3Q9UJK0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms