Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SCN11AQ9UI33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN11AQ9UI33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCN11AQ9UI33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms