Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM5BQ9UGL1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5BQ9UGL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM5BQ9UGL1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
KDM5BQ9UGL1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
KDM5BQ9UGL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms