Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MBD5Q9P267 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
MBD5Q9P267 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MBD5Q9P267 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MBD5Q9P267 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms