Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB20Q9NX57 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB20Q9NX57 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB20Q9NX57 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms