Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCH5Q9NX47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH5Q9NX47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH5Q9NX47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH5Q9NX47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms