Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO6Q9NRD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO6Q9NRD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms