Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC8Q9BY41 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC8Q9BY41 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms