Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB6Q9BUF5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB6Q9BUF5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms