Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCD2LQ9BRP1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDCD2LQ9BRP1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCD2LQ9BRP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms