Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PDCD2LQ9BRP1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDCD2LQ9BRP1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PDCD2LQ9BRP1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDCD2LQ9BRP1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PDCD2LQ9BRP1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDCD2LQ9BRP1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PDCD2LQ9BRP1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PDCD2LQ9BRP1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDCD2LQ9BRP1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDCD2LQ9BRP1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDCD2LQ9BRP1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PDCD2LQ9BRP1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDCD2LQ9BRP1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PDCD2LQ9BRP1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDCD2LQ9BRP1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDCD2LQ9BRP1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDCD2LQ9BRP1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDCD2LQ9BRP1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PDCD2LQ9BRP1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDCD2LQ9BRP1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDCD2LQ9BRP1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDCD2LQ9BRP1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDCD2LQ9BRP1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDCD2LQ9BRP1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PDCD2LQ9BRP1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PDCD2LQ9BRP1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PDCD2LQ9BRP1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDCD2LQ9BRP1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDCD2LQ9BRP1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDCD2LQ9BRP1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDCD2LQ9BRP1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDCD2LQ9BRP1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDCD2LQ9BRP1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDCD2LQ9BRP1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PDCD2LQ9BRP1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PDCD2LQ9BRP1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDCD2LQ9BRP1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDCD2LQ9BRP1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDCD2LQ9BRP1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDCD2LQ9BRP1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDCD2LQ9BRP1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDCD2LQ9BRP1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDCD2LQ9BRP1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PDCD2LQ9BRP1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDCD2LQ9BRP1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PDCD2LQ9BRP1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDCD2LQ9BRP1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDCD2LQ9BRP1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDCD2LQ9BRP1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDCD2LQ9BRP1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PDCD2LQ9BRP1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDCD2LQ9BRP1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDCD2LQ9BRP1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDCD2LQ9BRP1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDCD2LQ9BRP1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDCD2LQ9BRP1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDCD2LQ9BRP1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDCD2LQ9BRP1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDCD2LQ9BRP1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDCD2LQ9BRP1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDCD2LQ9BRP1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDCD2LQ9BRP1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PDCD2LQ9BRP1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDCD2LQ9BRP1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDCD2LQ9BRP1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDCD2LQ9BRP1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDCD2LQ9BRP1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDCD2LQ9BRP1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PDCD2LQ9BRP1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDCD2LQ9BRP1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDCD2LQ9BRP1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDCD2LQ9BRP1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDCD2LQ9BRP1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDCD2LQ9BRP1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDCD2LQ9BRP1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PDCD2LQ9BRP1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PDCD2LQ9BRP1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PDCD2LQ9BRP1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PDCD2LQ9BRP1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PDCD2LQ9BRP1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDCD2LQ9BRP1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PDCD2LQ9BRP1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDCD2LQ9BRP1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PDCD2LQ9BRP1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms