Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZSWIM1Q9BR11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM1Q9BR11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM1Q9BR11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms