Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP19Q99542 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP19Q99542 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP19Q99542 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms