Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF31Q96EP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF31Q96EP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms