Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
TOPBP1Q92547 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOPBP1Q92547 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOPBP1Q92547 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
TOPBP1Q92547 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms