Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM1BQ8NB78 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM1BQ8NB78 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM1BQ8NB78 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms