Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMPERQ8N8U9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMPERQ8N8U9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMPERQ8N8U9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms