Protein–RNA interactions for Protein: Q8J025

APCDD1, Protein APCDD1, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1Q8J025 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APCDD1Q8J025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APCDD1Q8J025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APCDD1Q8J025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms