Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD3Q86UT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD3Q86UT5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms