Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDZD3Q86UT5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDZD3Q86UT5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDZD3Q86UT5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PDZD3Q86UT5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDZD3Q86UT5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZD3Q86UT5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDZD3Q86UT5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDZD3Q86UT5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZD3Q86UT5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDZD3Q86UT5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDZD3Q86UT5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDZD3Q86UT5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDZD3Q86UT5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDZD3Q86UT5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDZD3Q86UT5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDZD3Q86UT5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDZD3Q86UT5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDZD3Q86UT5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDZD3Q86UT5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDZD3Q86UT5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDZD3Q86UT5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDZD3Q86UT5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDZD3Q86UT5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDZD3Q86UT5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDZD3Q86UT5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDZD3Q86UT5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PDZD3Q86UT5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZD3Q86UT5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDZD3Q86UT5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDZD3Q86UT5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZD3Q86UT5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDZD3Q86UT5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDZD3Q86UT5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDZD3Q86UT5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDZD3Q86UT5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PDZD3Q86UT5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZD3Q86UT5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDZD3Q86UT5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDZD3Q86UT5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PDZD3Q86UT5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZD3Q86UT5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZD3Q86UT5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZD3Q86UT5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDZD3Q86UT5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZD3Q86UT5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZD3Q86UT5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZD3Q86UT5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZD3Q86UT5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZD3Q86UT5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZD3Q86UT5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZD3Q86UT5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZD3Q86UT5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZD3Q86UT5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZD3Q86UT5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZD3Q86UT5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZD3Q86UT5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZD3Q86UT5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZD3Q86UT5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZD3Q86UT5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZD3Q86UT5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZD3Q86UT5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZD3Q86UT5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZD3Q86UT5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZD3Q86UT5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZD3Q86UT5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZD3Q86UT5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDZD3Q86UT5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZD3Q86UT5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZD3Q86UT5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZD3Q86UT5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZD3Q86UT5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZD3Q86UT5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZD3Q86UT5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZD3Q86UT5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZD3Q86UT5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZD3Q86UT5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZD3Q86UT5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZD3Q86UT5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZD3Q86UT5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZD3Q86UT5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZD3Q86UT5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZD3Q86UT5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZD3Q86UT5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZD3Q86UT5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZD3Q86UT5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZD3Q86UT5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZD3Q86UT5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZD3Q86UT5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZD3Q86UT5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZD3Q86UT5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZD3Q86UT5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms