Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP3Q7RTS5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP3Q7RTS5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP3Q7RTS5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OTOP3Q7RTS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms