Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q7L0L9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q7L0L9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q7L0L9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q7L0L9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q7L0L9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q7L0L9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q7L0L9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q7L0L9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q7L0L9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q7L0L9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q7L0L9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q7L0L9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q7L0L9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q7L0L9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q7L0L9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Q7L0L9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q7L0L9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q7L0L9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q7L0L9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Q7L0L9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q7L0L9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q7L0L9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q7L0L9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q7L0L9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q7L0L9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q7L0L9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q7L0L9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q7L0L9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q7L0L9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q7L0L9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q7L0L9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q7L0L9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q7L0L9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q7L0L9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q7L0L9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q7L0L9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q7L0L9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q7L0L9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q7L0L9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q7L0L9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Q7L0L9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Q7L0L9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q7L0L9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q7L0L9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q7L0L9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q7L0L9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Q7L0L9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q7L0L9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q7L0L9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q7L0L9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q7L0L9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q7L0L9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q7L0L9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q7L0L9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Q7L0L9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q7L0L9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q7L0L9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q7L0L9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q7L0L9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q7L0L9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q7L0L9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Q7L0L9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q7L0L9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q7L0L9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q7L0L9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q7L0L9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q7L0L9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q7L0L9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms