Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PAXIP1Q6ZW49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAXIP1Q6ZW49 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PAXIP1Q6ZW49 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAXIP1Q6ZW49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXIP1Q6ZW49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAXIP1Q6ZW49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXIP1Q6ZW49 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms