Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms