Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LHX8Q68G74 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LHX8Q68G74 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LHX8Q68G74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LHX8Q68G74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LHX8Q68G74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LHX8Q68G74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LHX8Q68G74 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LHX8Q68G74 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LHX8Q68G74 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LHX8Q68G74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LHX8Q68G74 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LHX8Q68G74 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LHX8Q68G74 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LHX8Q68G74 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LHX8Q68G74 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LHX8Q68G74 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LHX8Q68G74 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LHX8Q68G74 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LHX8Q68G74 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LHX8Q68G74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms