Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ECM29Q5VYK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ECM29Q5VYK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ECM29Q5VYK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms