Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARS2Q5T160 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RARS2Q5T160 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARS2Q5T160 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms