Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCBQ16585 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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