Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDB1Q16531 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
DDB1Q16531 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDB1Q16531 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDB1Q16531 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
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