Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCF4Q15080 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCF4Q15080 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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