Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFIAQ12857 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFIAQ12857 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFIAQ12857 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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