Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NFIAQ12857 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NFIAQ12857 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NFIAQ12857 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NFIAQ12857 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NFIAQ12857 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NFIAQ12857 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NFIAQ12857 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
NFIAQ12857 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NFIAQ12857 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NFIAQ12857 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NFIAQ12857 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NFIAQ12857 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NFIAQ12857 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NFIAQ12857 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NFIAQ12857 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NFIAQ12857 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NFIAQ12857 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NFIAQ12857 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
NFIAQ12857 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NFIAQ12857 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NFIAQ12857 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NFIAQ12857 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NFIAQ12857 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NFIAQ12857 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NFIAQ12857 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NFIAQ12857 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NFIAQ12857 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NFIAQ12857 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NFIAQ12857 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NFIAQ12857 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NFIAQ12857 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NFIAQ12857 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NFIAQ12857 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NFIAQ12857 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NFIAQ12857 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NFIAQ12857 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NFIAQ12857 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NFIAQ12857 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NFIAQ12857 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NFIAQ12857 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NFIAQ12857 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NFIAQ12857 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NFIAQ12857 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NFIAQ12857 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NFIAQ12857 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NFIAQ12857 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NFIAQ12857 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NFIAQ12857 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NFIAQ12857 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NFIAQ12857 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NFIAQ12857 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NFIAQ12857 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NFIAQ12857 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NFIAQ12857 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NFIAQ12857 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NFIAQ12857 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NFIAQ12857 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NFIAQ12857 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NFIAQ12857 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NFIAQ12857 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NFIAQ12857 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NFIAQ12857 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NFIAQ12857 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NFIAQ12857 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NFIAQ12857 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NFIAQ12857 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NFIAQ12857 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NFIAQ12857 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NFIAQ12857 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NFIAQ12857 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NFIAQ12857 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NFIAQ12857 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NFIAQ12857 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NFIAQ12857 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NFIAQ12857 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NFIAQ12857 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NFIAQ12857 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NFIAQ12857 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NFIAQ12857 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NFIAQ12857 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NFIAQ12857 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NFIAQ12857 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NFIAQ12857 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NFIAQ12857 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NFIAQ12857 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NFIAQ12857 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NFIAQ12857 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NFIAQ12857 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NFIAQ12857 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NFIAQ12857 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NFIAQ12857 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NFIAQ12857 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NFIAQ12857 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NFIAQ12857 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NFIAQ12857 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NFIAQ12857 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NFIAQ12857 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NFIAQ12857 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NFIAQ12857 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
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