Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNK2Q07912 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNK2Q07912 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms