Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNB1Q02641 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB1Q02641 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB1Q02641 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB1Q02641 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms