Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPAP53621 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPAP53621 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPAP53621 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPAP53621 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPAP53621 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPAP53621 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPAP53621 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPAP53621 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPAP53621 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPAP53621 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPAP53621 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPAP53621 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPAP53621 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPAP53621 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPAP53621 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPAP53621 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPAP53621 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COPAP53621 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPAP53621 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPAP53621 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPAP53621 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPAP53621 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPAP53621 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPAP53621 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPAP53621 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPAP53621 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPAP53621 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COPAP53621 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPAP53621 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPAP53621 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPAP53621 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPAP53621 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPAP53621 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPAP53621 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPAP53621 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPAP53621 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPAP53621 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPAP53621 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPAP53621 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPAP53621 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPAP53621 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPAP53621 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPAP53621 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPAP53621 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPAP53621 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPAP53621 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms