Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP98P52948 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP98P52948 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP98P52948 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP98P52948 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP98P52948 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP98P52948 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP98P52948 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP98P52948 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP98P52948 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP98P52948 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP98P52948 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP98P52948 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP98P52948 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP98P52948 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP98P52948 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP98P52948 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP98P52948 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP98P52948 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP98P52948 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP98P52948 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP98P52948 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP98P52948 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NUP98P52948 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP98P52948 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP98P52948 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP98P52948 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP98P52948 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP98P52948 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP98P52948 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP98P52948 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP98P52948 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP98P52948 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP98P52948 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP98P52948 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP98P52948 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP98P52948 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP98P52948 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP98P52948 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP98P52948 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP98P52948 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP98P52948 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP98P52948 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP98P52948 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP98P52948 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP98P52948 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP98P52948 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP98P52948 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP98P52948 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP98P52948 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP98P52948 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP98P52948 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP98P52948 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUP98P52948 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUP98P52948 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP98P52948 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms