Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NUP98P52948 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NUP98P52948 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NUP98P52948 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NUP98P52948 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NUP98P52948 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NUP98P52948 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
NUP98P52948 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
NUP98P52948 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP98P52948 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP98P52948 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NUP98P52948 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP98P52948 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NUP98P52948 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP98P52948 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP98P52948 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NUP98P52948 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NUP98P52948 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
NUP98P52948 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NUP98P52948 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP98P52948 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NUP98P52948 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NUP98P52948 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NUP98P52948 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NUP98P52948 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NUP98P52948 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NUP98P52948 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NUP98P52948 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NUP98P52948 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NUP98P52948 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NUP98P52948 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NUP98P52948 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NUP98P52948 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NUP98P52948 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NUP98P52948 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP98P52948 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP98P52948 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP98P52948 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP98P52948 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP98P52948 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP98P52948 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NUP98P52948 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NUP98P52948 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NUP98P52948 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NUP98P52948 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP98P52948 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP98P52948 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NUP98P52948 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NUP98P52948 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NUP98P52948 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP98P52948 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP98P52948 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NUP98P52948 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP98P52948 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NUP98P52948 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NUP98P52948 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP98P52948 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP98P52948 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP98P52948 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NUP98P52948 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP98P52948 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NUP98P52948 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NUP98P52948 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP98P52948 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP98P52948 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP98P52948 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NUP98P52948 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP98P52948 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP98P52948 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP98P52948 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP98P52948 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NUP98P52948 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NUP98P52948 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP98P52948 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP98P52948 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUP98P52948 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP98P52948 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NUP98P52948 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NUP98P52948 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NUP98P52948 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NUP98P52948 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUP98P52948 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP98P52948 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP98P52948 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP98P52948 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUP98P52948 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUP98P52948 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NUP98P52948 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
NUP98P52948 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUP98P52948 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NUP98P52948 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUP98P52948 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP98P52948 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP98P52948 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP98P52948 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP98P52948 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NUP98P52948 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NUP98P52948 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUP98P52948 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUP98P52948 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms